MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 49585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020834	TGG	2	6	77726	77731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335318
1502	NC_020834	TTAT	2	8	77770	77777	25 %	75 %	0 %	0 %	472335318
1503	NC_020834	TAT	2	6	77792	77797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335318
1504	NC_020834	TTA	2	6	77837	77842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335318
1505	NC_020834	AT	3	6	77886	77891	50 %	50 %	0 %	0 %	472335318
1506	NC_020834	TGG	2	6	77908	77913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335318
1507	NC_020834	TCCG	2	8	77951	77958	0 %	25 %	25 %	50 %	472335318
1508	NC_020834	CTT	2	6	77961	77966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335318
1509	NC_020834	GAA	2	6	78016	78021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335318
1510	NC_020834	TTGC	2	8	78025	78032	0 %	50 %	25 %	25 %	472335318
1511	NC_020834	A	6	6	78185	78190	100 %	0 %	0 %	0 %	472335318
1512	NC_020834	GTG	2	6	78220	78225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335318
1513	NC_020834	TTG	2	6	78349	78354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335318
1514	NC_020834	A	6	6	78391	78396	100 %	0 %	0 %	0 %	472335318
1515	NC_020834	GT	3	6	78399	78404	0 %	50 %	50 %	0 %	472335318
1516	NC_020834	GGCA	2	8	78474	78481	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_020834	AATA	2	8	78500	78507	75 %	25 %	0 %	0 %	472335319
1518	NC_020834	GATT	2	8	78530	78537	25 %	50 %	25 %	0 %	472335319
1519	NC_020834	A	6	6	78593	78598	100 %	0 %	0 %	0 %	472335319
1520	NC_020834	TAT	2	6	78626	78631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335319
1521	NC_020834	GTG	2	6	78690	78695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335319
1522	NC_020834	GCA	2	6	78758	78763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335319
1523	NC_020834	GAA	2	6	78789	78794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335319
1524	NC_020834	ATG	2	6	78834	78839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335319
1525	NC_020834	AGC	2	6	78846	78851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335319
1526	NC_020834	ACC	2	6	78903	78908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335319
1527	NC_020834	A	6	6	78987	78992	100 %	0 %	0 %	0 %	472335320
1528	NC_020834	TCT	2	6	79011	79016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335320
1529	NC_020834	ATT	2	6	79035	79040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335320
1530	NC_020834	TGC	2	6	79156	79161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335320
1531	NC_020834	ATC	2	6	79176	79181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335320
1532	NC_020834	ATT	2	6	79184	79189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335320
1533	NC_020834	TGA	2	6	79292	79297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335320
1534	NC_020834	AAG	2	6	79381	79386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335320
1535	NC_020834	TGGT	2	8	79434	79441	0 %	50 %	50 %	0 %	472335320
1536	NC_020834	A	6	6	79452	79457	100 %	0 %	0 %	0 %	472335320
1537	NC_020834	TTG	2	6	79480	79485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335320
1538	NC_020834	CAAC	2	8	79493	79500	50 %	0 %	0 %	50 %	472335320
1539	NC_020834	CCA	2	6	79503	79508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335320
1540	NC_020834	TCAA	2	8	79522	79529	50 %	25 %	0 %	25 %	472335320
1541	NC_020834	GCG	2	6	79554	79559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335320
1542	NC_020834	A	6	6	79592	79597	100 %	0 %	0 %	0 %	472335320
1543	NC_020834	GA	3	6	79644	79649	50 %	0 %	50 %	0 %	472335320
1544	NC_020834	AG	3	6	79847	79852	50 %	0 %	50 %	0 %	472335320
1545	NC_020834	CGC	2	6	80007	80012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335320
1546	NC_020834	AAC	2	6	80203	80208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335320
1547	NC_020834	TTC	2	6	80250	80255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335320
1548	NC_020834	GGT	2	6	80268	80273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335320
1549	NC_020834	TCT	2	6	80281	80286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335320
1550	NC_020834	ATT	2	6	80324	80329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335321
1551	NC_020834	GTGA	2	8	80372	80379	25 %	25 %	50 %	0 %	472335321
1552	NC_020834	TGG	2	6	80397	80402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335321
1553	NC_020834	TGA	2	6	80539	80544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335321
1554	NC_020834	TTTA	2	8	80578	80585	25 %	75 %	0 %	0 %	472335321
1555	NC_020834	GA	3	6	80629	80634	50 %	0 %	50 %	0 %	472335321
1556	NC_020834	GTT	2	6	80644	80649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335321
1557	NC_020834	ATG	3	9	80652	80660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335321
1558	NC_020834	ATT	2	6	80678	80683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335321
1559	NC_020834	AGA	2	6	80704	80709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335321
1560	NC_020834	TGA	2	6	80761	80766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335321
1561	NC_020834	TAT	2	6	80917	80922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335321
1562	NC_020834	TGA	2	6	80932	80937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335321
1563	NC_020834	GGAG	2	8	81032	81039	25 %	0 %	75 %	0 %	472335321
1564	NC_020834	AGA	2	6	81067	81072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335321
1565	NC_020834	GAG	2	6	81188	81193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335321
1566	NC_020834	TGA	3	9	81232	81240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335321
1567	NC_020834	CTG	2	6	81260	81265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335321
1568	NC_020834	A	6	6	81284	81289	100 %	0 %	0 %	0 %	472335321
1569	NC_020834	ATT	2	6	81293	81298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335321
1570	NC_020834	CAA	2	6	81365	81370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335321
1571	NC_020834	CTA	2	6	81372	81377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335321
1572	NC_020834	TTC	2	6	81424	81429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335321
1573	NC_020834	GAC	2	6	81501	81506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335321
1574	NC_020834	TTG	2	6	81540	81545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335321
1575	NC_020834	GGT	2	6	81550	81555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335321
1576	NC_020834	GAA	2	6	81563	81568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335321
1577	NC_020834	TTA	2	6	81570	81575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335321
1578	NC_020834	CCA	2	6	81588	81593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335321
1579	NC_020834	ATT	2	6	81617	81622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335321
1580	NC_020834	TTTG	2	8	81729	81736	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020834	AACGG	2	10	81826	81835	40 %	0 %	40 %	20 %	472335322
1582	NC_020834	CGA	2	6	81891	81896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335322
1583	NC_020834	CCAGAA	2	12	81911	81922	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	472335322
1584	NC_020834	GGT	2	6	81975	81980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335322
1585	NC_020834	GAT	2	6	82028	82033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335322
1586	NC_020834	AATTT	2	10	82056	82065	40 %	60 %	0 %	0 %	472335322
1587	NC_020834	TGC	2	6	82169	82174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335322
1588	NC_020834	GTG	2	6	82216	82221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335322
1589	NC_020834	CTG	2	6	82279	82284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335322
1590	NC_020834	CATT	2	8	82288	82295	25 %	50 %	0 %	25 %	472335322
1591	NC_020834	AGC	2	6	82319	82324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335322
1592	NC_020834	C	6	6	82369	82374	0 %	0 %	0 %	100 %	472335322
1593	NC_020834	ATA	2	6	82392	82397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335322
1594	NC_020834	AAT	2	6	82403	82408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335322
1595	NC_020834	ACG	2	6	82433	82438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335322
1596	NC_020834	TTG	2	6	82454	82459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335322
1597	NC_020834	TTGTG	2	10	82498	82507	0 %	60 %	40 %	0 %	472335323
1598	NC_020834	A	6	6	82539	82544	100 %	0 %	0 %	0 %	472335323
1599	NC_020834	AATT	2	8	82566	82573	50 %	50 %	0 %	0 %	472335323
1600	NC_020834	ATTA	2	8	82584	82591	50 %	50 %	0 %	0 %	472335323
1601	NC_020834	ATAA	2	8	82609	82616	75 %	25 %	0 %	0 %	472335323
1602	NC_020834	TTA	2	6	82617	82622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335323
1603	NC_020834	TTTG	2	8	82648	82655	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020834	AGA	2	6	82719	82724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020834	ATC	2	6	82736	82741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335324
1606	NC_020834	ACC	2	6	82755	82760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335324
1607	NC_020834	TCA	2	6	82983	82988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335324
1608	NC_020834	ATA	2	6	83040	83045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335324
1609	NC_020834	ATA	2	6	83070	83075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335324
1610	NC_020834	AGT	2	6	83086	83091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335324
1611	NC_020834	ACC	2	6	83114	83119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335324
1612	NC_020834	CCT	2	6	83133	83138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335324
1613	NC_020834	GT	3	6	83150	83155	0 %	50 %	50 %	0 %	472335324
1614	NC_020834	TTG	2	6	83216	83221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335324
1615	NC_020834	TGA	2	6	83341	83346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335324
1616	NC_020834	TAC	2	6	83357	83362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335324
1617	NC_020834	AGC	2	6	83369	83374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335324
1618	NC_020834	GGC	2	6	83456	83461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335324
1619	NC_020834	T	6	6	83515	83520	0 %	100 %	0 %	0 %	472335324
1620	NC_020834	GAC	2	6	83564	83569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335324
1621	NC_020834	ATT	2	6	83627	83632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335324
1622	NC_020834	GAA	2	6	83708	83713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335324
1623	NC_020834	GGT	2	6	83738	83743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335324
1624	NC_020834	T	6	6	83756	83761	0 %	100 %	0 %	0 %	472335324
1625	NC_020834	AGT	2	6	83845	83850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335324
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1627	NC_020834	CTT	2	6	84004	84009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335324
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